新型冠状病毒2019-nCoV科研快讯(三)

   时间:2020-02-11 [ ] 浏览次数:87 来源:文献馆 视力保护色:

 

 编者说明

本期科研快讯是贵州省科学技术情报研究所(贵州省科技发展战略研究院)基于2020年2月6日—10日国内外医学期刊发表的2019新型冠状病毒学术成果及权威官方发布的2019-nCOV研发资讯,对2019-nCoV检测试剂、诊疗、病毒库建设、病毒溯源、流行趋势多个方面的科研进展进行概述整理,为NCP的研究、治疗、疫情控制等方面提供参考。

根据疫情防控的需要,本科研快讯将持续跟踪2019-nCOV最新研究成果,每2日发布1期。如需获取快讯中提到的论文原文,可联系贵州省科学技术情报研究所(联系方式:0851—86857716)。

因快讯发布比较匆忙,难免有所失误,欢迎行业各界批评指导!


一、新冠肺炎检测试剂科研进展

1. 新冠肺炎检测试剂科研进展回顾

 

1月26日,华中科技大学同济医学院附属协和医院表示,已成立新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测实验室,最快6小时内可出结果。

1月27日,上海辉睿生物和上海捷诺生物针对2019-nCov的设计生产的PCR检测盒子通过国家疾控中心的认证并投入使用,可将检测时间缩短至1-2小时。

1月31日,成都迈克生物成功研发出西南地区首个新型冠状病毒检测试剂盒,可实现2小时内96份样本的快速检测。(截至目前,该试剂盒已完成临床试验)

2月1日,安徽安龙基因科技有限公司生产的新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒首批上市,该产品90分钟即可对提取的RNA完成检测。

2月2日,天津大学联合金麦格团队研发的检测试剂盒1小时高灵敏检测新型冠状病毒。(截至目前,该试剂盒正处于临床验证阶段)

2月4日,青岛科技大学与青岛耐德生物技术有限公司合作,成功研发 新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒,该试剂盒可以在30分钟内完成核酸扩增检测。(截至目前,该试剂盒已报国家药监局审批)

2月6日,无锡奇天基因与中国疾病预防控制中心病毒预防控制所联合研制成功的新型冠状病毒核酸等温扩增快速检测试剂盒,可实现8-15分钟检测出结果。(截至目前,该试剂盒已报国家药监局审批)

2月7日,无锡科智达科技有限公司研制的新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测系列产品,可在30分钟完成核酸检测,最快8分钟出阳性结果。(截至目前,该试剂盒已报国家药监局审批)

2月7日,辽宁迈迪生物科技有限公司开发出特殊一步检测法,无需样本RNA提取和纯化过程直接检测,可将检测时间缩短至90分钟以内。(截至目前,该试剂盒正处于临床验证阶段)

2月8日,天津大学与北京华科泰生物等单位研发出15分钟快速检测新冠病毒试剂盒。(截至目前,该试剂盒正处于临床验证阶段)

据国家药品监督管理局2020年02月01日 发布新闻,国家药监局将根据疫情防控需要,继续做好相应产品应急审批工作。截至目前,已应急审批7个新型冠状病毒核酸检测试剂。
  来源: 国家药品监督管理局

 

2.美国CDC宣布其最新开发的新型冠状病毒快速检测试剂盒,四小时内出结果

 

美国时间2月6日,美国疾控中心 (US CDC) 宣布,已于周三开始向全球实验室运送其最新开发的新型冠状病毒快速检测试剂盒。CDC称,这些试剂盒CDC 2019-nCoV Real Time RT-PCR)可以在四个小时内得出结果,将帮助全球实验室快速确认新型冠状病毒病例。CDC主任,美国病毒学家雷德菲尔德(Robert R. Redfield)博士在周四的一份声明中说:“我们的目标是及早发现新病例,并防止新型冠状病毒的进一步传播。将这些试剂分发给各州实验室、联邦政府的合作伙伴以及更广泛的全球公共卫生界,将帮助我们加快应对这一不断变化的全球公共卫生挑战。”

来源:

CDC US 官网

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/testing.htm

 

3. 香港科技大学研制的新型冠状病毒测试仪投用,40分钟出结果

 

2月7日,香港科技大学物理学系教授温维佳在实验室内展示新研制的全球最快新型冠状病毒肺炎检测仪 。香港科技大学6日公布,研制出快速检测新冠肺炎(2019-nCoV)的便携式检测仪,利用微流生物芯片技术,从取样到检测结果只需约40分钟,较目前通用的检测方法聚合酶连锁反应(PCR)技术所需的1.5至3个小时大幅缩短。,测试仪设计成便携式手提箱型,可用于户外,适合各级疾控中心、海关、出入境检验检疫部门、及护老院等,目前该检测仪及试剂盒已于深圳及广州的疾控中心应用。

来源:

https://www.sogou.com/link?url=hedJjaC291N4CsCOxmWyq1OMztQ6YkQ0_N3i8iYux7UDNG825UZ70nTFBj9KtFFG0dlF50bTPIVgnwXASTDFz0PUj2UtV8sZ

 

二、新型冠状病毒肺炎诊疗科研进展

1.2019-nCoV 的潜在治疗策略:Rivaroxaba、缬沙坦、双嘧达莫

 

   2020年2月7日,广州医科大学张玉霞、张彦及中山大学罗海彬共同通讯在预印版平台medRxiv上发表未经同行评议的题为“ACE2 expression by colonic epithelial cells is associated with viral infection, immunity and energy metabolism的研究论文,该研究通过分析来自对照受试者和患有结肠炎或炎性肠病(IBD)的受试者的单细胞RNA测序数据,发现结肠细胞中ACE2的表达与调节病毒感染,先天和细胞免疫的基因正相关,但与病毒转录,蛋白质翻译,体液免疫,吞噬作用和补体激活负相关。总之,该研究表明ACE2在介导2019-nCoV感染的易感性和免疫性中可能起双重作用。

鉴于高血压在2019-nCoV严重肺炎中很常见,因此很可能在严重肺炎患者的肺部激活肾素-血管紧张素系统(RAS)。Xa抑制剂RivaroxabanAT1R阻断剂缬沙坦(DOI10.1183 / 13993003.congress-2019.PA2469在实验模型和临床试验中可有效缓解肺损伤和栓塞,它们在治疗2019-nCoV中的疗效值得考虑。双嘧达莫是另一种抗凝药物:在一项试验性试验中,双嘧达莫的使用可促进结肠炎或IBD患者的粘膜愈合并改善其临床症状。更重要的是,已发表的临床研究,包括在中国进行的研究证明双嘧达莫对病毒感染具有广谱抗病毒活性。还可能需要研究双嘧达莫对2019-nCoV感染患者的治疗效果。

来源:

http://dy.163.com/v2/article/detail/F4UBQE0105329KGN.html

 

2.新冠肺炎中位潜伏期为3天,最长可达24天

2月9日,由国家卫健委高级别专家组组长、中国工程院院士钟南山领衔的Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China中国2019年新型冠状病毒感染的临床特征)研究,在预印本网站medRxiv上发表。钟南山等人对1099例(截至1月29日)新冠肺炎确诊患者的临床特征进行了回顾性研究。研究发现,新冠肺炎的中位潜伏期为3.0天,最长可达24天,可出现家族聚集性发病、无症状感染者传播、3阶段暴发模式等。同时,不排除“超级传播者”的存在,新冠肺炎可发生在整个年龄段,其中0.9%的患者在15岁以下。根据目前观察的情况,新冠肺炎的病死率约为2.7%,且患者大多为中老年人,病死率虽然比普通流感强,但远比SARS冠状病毒、埃博拉病毒或H7N9流感病毒低。

来源:medRxiv preprint first posted online Feb. 9, 2020 ;doi:http://dx.doi.org/10.1101/2020.02.06.20020974

 

3. 儿童2019新型冠状病毒感染的诊断与防治建议(试行第一版)

根据国家卫生健康委员会“新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第五版)”和WHO“疑似新型冠状病毒感染造成严重急性呼吸道感染的临床处置暂行指南”[3,4],由中华医学会儿科学分会和中华儿科杂志编辑委员会组织相关专业专家结合全国已报告儿童确诊病例的特点和武汉市成人患者的临床诊治经验,提出儿童2019-nCoV感染的诊断和防治建议,供儿科临床医生参考。

来源:中华医学会儿科学分会, 中华儿科杂志编辑委员会. 儿童2019新型冠状病毒感染的诊断与防治建议(试行第一版) [J] . 中华儿科杂志,2020,58( 00 ): E004-E004. DOI:

10.3760/cma.j.issn.0578-1310.2020.0004

 

4. 新冠病毒疫苗开始动物试验,最快4月进入临床 

据第一财经记者2月10日的报道,日前,中国科研团队宣布,最新研发的新型冠状病毒的疫苗已经开始动物试验。这距离中国疾控中心1月24日成功分离我国首株新型冠状病毒毒种仅两周时间,这款疫苗由中国疾控中心、上海同济大学医学院和上海生物技术公司斯微生物共同设计开发,斯微生物提供生产疫苗样本。周日,新疫苗的样本已经在100多只健康的小鼠身上注射。中国疾控中心的官员向第一财经记者证实了新型冠状病毒疫苗的进展,不过强调:“这还是非常早期的阶段,要用到人还有很多‘步’要走。根据斯微生物方面透露,1月底,研发人员在获得中国疾控中心提供的新型冠状病毒抗原后,就开始了两周的疫苗研制工作。该疫苗是基于mRNA(信使核糖核酸)平台开发的,mRNA是DNA单链转录而来,和DNA一样也携带遗传信息,能够指导蛋白合成。此外,在疫苗的动物试验中使用了9至12种不同的抗原。

来源:搜狐网

http://www.sohu.com/a/371873668_114986?scm=0.0.0.0

 

5.应对2019-nCoV精神压力的建议

 

2月7日,北京大学陆林团队在国际顶级医学期刊Lancet在线发表题为“2019-nCoV epidemic: address mental health care to empower society”的通讯文章,该研究提出了六项应对精神压力的建议:其中包括评估披露信息的准确性,加强社会支持系统(例如家人和朋友),消除与流行病相关的谣言,在安全条件下维持正常生活,并使用心理社会服务系统,特别是针对医护人员,患者,家庭成员和公众的电话和互联网咨询。这些建议,对于抗击疫情有非常积极及重要的作用。

来源:

http://dy.163.com/v2/article/detail/F4UB1EEN05329KGN.html

 

三、冠状病毒数据库最新进展

1.冠状病毒数据库(CoVdb),在线基因组学和蛋白质组学分析平台

2月8日,重庆大学等研究机构在预印本bioRxiv 平台上发表论文:A database resource for Genome-widedynamics analysis of Coronaviruses on a historical and global scale(全球范围内历年来冠状病毒全基因组动态分析的数据库资源)。章阐述了 重庆大学等机构的研究人员开发了冠状病毒数据库(CoVdb),一个在线基因组学和蛋白质组学分析平台。根据公开访问的冠状病毒基因组信息,该数据库注释了每个菌株的基因组,并鉴定了Genebank中所有可用菌株中780个可能的ORF。此外,CoVdb还对冠状病毒菌株的所有已发布基因组进行了全面评估,包括历史和全球范围内的种群遗传学分析、功能分析和结构分析。在该数据库中,研究人员可以轻松地获得冠状病毒基因的基本信息,包括该基因在菌株之间的分布、保守或高突变区域、基因可能的亚细胞位置和拓扑结构。此外,也提供了用于人口遗传学分析结果的滑动窗口,从而促进了基因组水平的遗传学和进化分析。可以从http://covdb.popgenetics.net免费访问CoVdb。

 来源:bioRxiv preprint first posted online Feb. 7, 2020; doi: http://dx.doi.org/10.1101/2020.02.05.920009. 

 

四、2019-nCoV病毒溯源最新进展

1.新研究否定新冠病毒的中间宿主是蛇,也否定其存在HIV蛋白插入

2月9日,预印本网站bioRxiv更新一篇新冠病毒相关论文,Protein structure and sequence re-analysis of 2019-nCoV genome does not indicate snakes as its intermediate host or the unique similarity between its spike protein insertions and HIV-1(对新型冠状病毒基因组蛋白质结构及序列的重新分析,没有证据表明蛇是其中间宿主,也未能证明其S蛋白插入物与HIV-1有独特的相似性)。论文中美国密歇根大学的研究人员使用最新的生物信息学方法和数据库在大规模数据集上进行了分析,认为2019-nCoV的中间宿主相比较于蛇更可能是哺乳动物和鸟类,并且在刺突蛋白中观察到的新插入序列是从蝙蝠冠状病毒自然进化而来的。

来源:bioRxiv preprint first posted online Feb. 8, 2020; doi: http://dx.doi.org/10.1101/2020.02.04.933135

 

五、2019-nCoV的流行病学最新研究进展

1.非洲国家应为新冠病毒的传播做好准备

 

2月8日,来自比利时、美国、法国、英国、等多家研究机构俄医院在预印本bioRxiv 平台上发表论文:Preparedness and vulnerability ofAfrican countries against introductions of 2019-nCoV。研究人员使用了从中国感染省份的机场出发并飞往非洲的航空旅行量的数据来估计每个国家引入的风险。研究人员用两个指标确定了国家发现和应对病例的能力:世卫组织《国际卫生条例监测和评估框架》定义的准备情况,以及传染病脆弱性指数定义的脆弱性。调查结果表明,进口风险最高的国家(埃及、阿尔及利亚、南非共和国)对疫情爆发具有中等至高能力。处于中等风险的国家(尼日利亚、埃塞俄比亚、苏丹、安哥拉、坦桑尼亚、加纳、肯尼亚)有不等的能力,脆弱性高。研究人员确定了三类国家,它们分别承受来自广东、福建和北京等地区的相同风险。因此,非洲的一些国家正在加紧准备,以发现并应对2019-nCoV的输入。

来源:

medRxiv preprint first posted online Feb. 7, 2020 ; doi: http://dx.doi.org/10.1101/2020.02.05.20020792

 

 

2. 2019-nCoV的传播速度可能比之前估计的要快

2月9日,medRxiv预印本上刊登了来自美国剑桥大学、密歇根大学、宾夕法尼亚大学的题为“Analysis of the epidemic growth of the early 2019-nCoV outbreak using internationally confirmed cases”的文章。分析结果表明,文中的模型很好地拟合了感染时间的分布。假设到选定国家和地区的旅行率(travel rate)在研究期间是恒定的,文章发现该流行病每2.9天(95%置信区间:2天—4.1天)就会成倍增长。使用之前报告的2019-nCoV潜伏期时间,估计基本繁殖数(basic reproduction number, R0)为5.7(95%置信区间:3.4—9.2)。该文章中估计的流行病学参数高于之前利用武汉确诊病例研究报告的数值,表明2019-nCoV的传播速度可能比之前估计的要快。此前,Li等在《新西兰医药杂志》上根据武汉首批425名2019-nCoV患者资料估计疫情每7.4天就会扩大一倍,估计的基本繁殖数为2.2(95%[CI]:1.4-3.9),Wu等在《柳叶刀》的另一篇报道中估计的基本繁殖数为2.7(95%CrI:2.5–2.9)。Read、Zhao等人则报告了更大的基本繁殖数2.24—3.58

来源:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.06.20020941v1